1901（明治34）年、翌年（明治35年）改称された早稲田大学の前身である東京専門学校に創部。

初代野球部長である安部磯雄先生のもと、翌1902（明治35）年、戸塚球場（後の安部球場。現早稲田大学学術情報センター）を造営。1905（明治38）年には安部先生の提言により、世界的な視野から野球を学ぶことを目標に、日本野球チームとして初めての米国遠征を行った。1925年に東京六大学野球連盟発足。

創部当時から、安部先生の言葉である「知識は学問から、人格はスポーツから」という「文武両道」の精神をかかげ、大学野球の範となることを目標に、以来百余年にわたり、次代を担う若人の集う大学野球部である。

1925（大正14）年、東京六大学リーグに参加。2023（令和5）年、秋のリーグ戦までの成績は優勝回数46回、1339勝804敗97分である。1987（昭和62）年、東京都西東京市東伏見に球場と寮を移し、現在に至っている。

橋戸信(日本初のプロ野球球団を創設、野球殿堂入り)

笠原和夫(元南海ホークス)

蔭山和夫(元南海ホークス)

石井藤吉郎(野球殿堂入り)

末吉俊信(元毎日オリオンズ)

荒川博(元毎日オリオンズ、読売ジャイアンツ、ヤクルトスワローズ)

広岡達郎(元読売ジャイアンツ等、野球殿堂入り)

石井連蔵(野球殿堂入り)

福嶋一雄(2013年野球殿堂入り)

木村保(元南海ホークス)

森徹(元中日ドラゴンズほか)

近藤昭仁(元大洋ホエールズほか)

木次文夫(元読売ジャイアンツほか)

徳武定祐(元国鉄スワローズほか)

安藤元博(元東映フライヤーズ、読売ジャイアンツ)

江尻亮(元大洋ホエールズほか)

宮本洋二郎(元読売ジャイアンツ、広島東洋カープ、南海ホークス)

大塚弥寿男(元東京オリオンズ)

八木沢荘六(元東京オリオンズ、西武ライオンズ、横浜ベイスターズほか)

西田暢(元中日ドラゴンズ)

高橋直樹(元東映フライヤーズ、広島東洋カープ、西武ライオンズほか)

三輪田勝利(元阪急ブレーブス)

荒川堯(元大洋ホエールズ、ヤクルトアトムズ)

谷沢健一(元中日ドラゴンズ、西武ライオンズ)

小田義人(元ヤクルトアトムズ、南海ホークス、近鉄バファローズ)

小坂敏彦(元読売ジャイアンツ、日本ハムファイターズ)

安田猛(元ヤクルトアトムズ)

大木勝年(元ヤクルトアトムズ)

金子勝美(元中日ドラゴンズ)

中村勝広(元阪神タイガース、オリックスバファローズ)

楠城徹(元西武ライオンズ)

鈴木治彦(元西武ライオンズ)

松本匡史(元読売ジャイアンツ、東北楽天ゴールデンイーグルス)

吉沢俊幸(元阪急ブレーブス、南海ホークス、阪神タイガース)

八木茂(元阪急ブレーブス、阪神タイガース)

山倉和博(元読売ジャイアンツ、福岡ソフトバンクホークス)

岡田彰布(現阪神タイガース監督)

有賀佳弘(元阪急ブレーブス、中日ドラゴンズ)

島貫省一(元読売ジャイアンツ、近鉄バファローズ)

應武篤良(1988年五輪男子野球代表銀メダル)

仁村薫(元読売ジャイアンツ、中日ドラゴンズほか)

加藤正樹(元近鉄バファローズ)

水口栄二(元オリックスバファローズ、現阪神タイガース打撃コーチ)

仁志敏久(元読売ジャイアンツ、横浜ベイスターズほか)

織田淳哉(元読売ジャイアンツ)

荒井修光(元日本ハムファイターズ)

三澤興一(元読売ジャイアンツほか、現読売ジャイアンツ三軍投手チーフコーチ)

藤井秀悟(元東京ヤクルトスワローズ、北海道日本ハムファイターズほか)

鎌田祐哉(元東京ヤクルトスワローズ、東北楽天ゴールデンイーグルスほか)

東辰弥(元阪神タイガース)

江尻慎太郎(元北海道日本ハムファイターズ、横浜ベイスターズほか)

和田毅(現福岡ソフトバンクホークス)

青木宣親(現東京ヤクルトスワローズ)

鳥谷敬(元阪神タイガース、千葉ロッテマリーンズ)

比嘉寿光(元広島東洋カープ)

由田慎太郎(元オリックスバファローズ、現オリックスバファローズ育成コーチ)

田中浩康(元東京ヤクルトスワローズほか、現横浜DeNAベイスターズコーチ)

越智大祐(元読売ジャイアンツ)

武内晋一(元東京ヤクルトスワローズ)

大谷智久(元千葉ロッテマリーンズ、現千葉ロッテマリーンズ二軍投手コーチ)

宮本賢(元北海道日本ハムファイターズ)

山本一徳(元北海道日本ハムファイターズ、千葉ロッテマリーンズ)

上本博紀(元阪神タイガース、現阪神タイガース二軍野手コーチ)

細山田武史(元横浜DeNAベイスターズ、福岡ソフトバンクホークス)

松本啓二朗(元横浜DeNAベイスターズ)

須田幸太(元横浜DeNAベイスターズ)

松下建太(元埼玉西武ライオンズ)

大石達也(元埼玉西武ライオンズ、現埼玉西武ライオンズファームコーチ)

斎藤佑樹(元北海道日本ハムファイターズ)

福井優也(元広島東洋カープ、東北楽天ゴールデンイーグルス)

土生翔平(元広島東洋カープ)

杉山翔大(元中日ドラゴンズ)

横山貴明(元東北楽天ゴールデンイーグルス)

有原航平(元北海道日本ハムファイターズほか、現福岡ソフトバンクホークス)

中村奨吾(現千葉ロッテマリーンズ、2017年アジアプロ野球チャンピオンシップ代表金メダル)

高梨雄平(元東北楽天ゴールデンイーグルス、現読売ジャイアンツ)

重信慎之介(現読売ジャイアンツ)

茂木栄五郎(現東北楽天ゴールデンイーグルス)

石井一成(現北海道日本ハムファイターズ)

大竹耕太郎(元福岡ソフトバンクホークス、現阪神タイガース)

小島和哉(現千葉ロッテマリーンズ)

早川隆久(現東北楽天ゴールデンイーグルス、2023年アジアプロ野球チャンピオンシップ代表金メダル)

徳山壮磨(現横浜DeNAベイスターズ)

西垣雅矢(現東北楽天ゴールデンイーグルス)

蛭間拓哉(現埼玉西武ライオンズ)